El bachillerato, al que se accede tras superar la Educación Secundaria Obligatoria, tiene una duración de dos cursos académicos, se estructura en tres modalidades, con tres grupos de materias: un grupo de asignaturas troncales obligatorias, las cursan todos los alumnos y garantizan la formación general unitaria de todos los alumnos; una materia troncal obligatoria de cada una de las modalidades, que garantiza una formación común a todo el alumnado de una misma modalidad de bachiller, y un grupo de materias optativas.
El Diploma Dual es el programa oficial de convalidación internacional de títulos de bachillerato que permite a los alumnos obtener dos titulaciones simultáneas: el Bachillerato Español y el American High School Diploma, que está reconocido en todas las universidades del mundo.
El Colegio Vizcaya facilita la obtención de diferentes titulaciones, tanto de idiomas (inglés, euskera, francés, alemán), como de capacitación informática (IT Txartela).